Passo 1 - Vá até sua página de CTes e clique no CTe que você deseja complementar.
Passo 2 - Clique no botão com três pontinhos, como destacado abaixo, e em seguida, clique em "Gerar CTe complementar".
Passo 3 - Digite o valor que você deseja complementar no campo "Valor do complemento" e clique em "Emitir".
Pronto! Um CTe Complementar será criado e você poderá visualizá-lo na página inicial onde os CTes estão listados.