Passo 1 - Na página principal, clique no botão "Emitir CTe", localizado no bloco de informações da sua empresa.

Passo 2 - Ao abrir uma nova tela para emitir seu CTe, clique na aba "Geral" e preencha os campos necessários manualmente. Ao finalizar essa etapa, clique em "continuar".

Passo 3 - Na aba "Modal", selecione o tipo de modal desejado e digite o RNTRC do emitente.

Passo 4 - Na aba "Carga", vá até o campo do tipo de documento e selecione a opção "NF-e" e em seguida, clique no botão "Adicionar".

Passo 5 - Ao abrir uma nova janela, você deverá preencher a numeração da chave de acesso da Nota Fiscal eletrônica (NFe), referente ao produto que será transportado.

Feito isso, clique em "Salvar" e preencha os demais campos normalmente.

Passo 6 - Na aba "Valores", preencha os valores referentes ao frete e aos impostos.

Passo 7 - Na última aba "Avançado", verifique se as informações estão corretas. Feito isso, clique em "concluir".

Passo 8 - Por fim, ao abrir uma nova tela com o CTe recém preenchido, clique em "emitir CTe".

Obs.: para imprimir seu CTe autorizado, basta clicar no botão "Imprimir DACTE(s)", como mostra a imagem abaixo.