PASSO 1 - Para extrair relatórios em Excel dos emissores de CTe e de MDFe, acesse a página de lista de CTes ou de MDFes e aplique filtro definindo os parâmetros desejados:

PASSO 2 - Quando aparecer o resultado da pesquisa, selecione todas as emissões, e depois clique em XLS:

Pronto, agora você tem seu relatório em Excel!